帰宅後にiPodを再度（Windows経由で）ファームウエアアップデート、ならびに工場出荷状態への初期化したところ、今度は正常に空き容量が（約37GB）認識されて、前回入っていた全曲を転送することが出来た。ちなみにWindowsフォーマットで初期化されたiPodへの曲転送はMacから正常に行うことが出来た。結局Mac/Windowsの相互使用についてはどうもよくわからない（出来るの？出来ないの？）ということで。
今昨晩一回目のファームウエア更新後のiPod情報をよく見てみると、「空き」が確かに3.0GBと表示されている。どうやら昨晩のファームウエアアップデートが失敗していただけらしい。やれやれ、よかった。